随着我国社会经济的发展，医学教育结构不合理愈显突出，需要加以调整。医学教育内部存在的问题主要表现在以下方面：医学院校的招生和培养还没有形成有效的适应市场经济规律的运行模式，在管理上缺乏卫生、教育和计划部门之间的有效协调。医学院校的招生规模、专业设置等不能较好地适应卫生事业改革与发展的需要；医学教育的结构不够合理，医学各专业领域的人才培养没有协调发展。
卫生部、教育部将调整医学教育层次结构，压缩中等教育，调整专科教育，积极发展本科教育，加速发展研究生教育。到2005年，包括高等职业技术教育的本专科教育和研究生教育年招生总量占总体的比例达到60％以上，到2015年增长到70％以上。同时要调整医学教育资源和卫生人力资源在地理分布上的不平衡，按照区域化和医学教育资源配置合理化的原则进行学校布局调整，调整的重点对象是各级各类中等卫生学校。另外，开展社区卫生人才培养，加强全科医学教育和卫生管理人才的培养，加大全科医师的比例，积极发展医学相关类专业。
